Sekcja Medycyny Eksperymentalnej została założona w kwietniu 2015 roku. Zajmuje się zadaniami z zakresu wspomaganych technik rozrodu takich jak zapłodnienie in vitro, transfer zarodków, chirurgia klasycznej i laparoskopowa oraz medycyna weterynaryjna zwierząt laboratoryjnych i doświadczalnych. Studenci będący członkami koła mają możliwość uczestniczenia w pracach badawczych odbywających się w Ośrodku Medycyny Eksperymentalnej i Innowacyjnej.